日本人男性の3人に1人が父から受け継ぐ「Y染色体ハプログループD」。その“いちばん近い親戚”は、アジアではなくナイジェリアで見つかりました。
このチャンネルは、遺伝学・考古学・地質学などの最新の論文を手がかりに、世界に残された謎を視聴者の皆さんと一緒に紐解いていくというコンセプトで運営しています。
確認できる事実にもとづいて構成していますが、そこから先の解釈はあくまで考察であり、確定した答えではありません。特定の民族・国・団体を優劣づけたり批判したりする意図はありません。
ぜひ、みなさんの謎に対する仮説や意見もコメントでお聞かせください。
■この動画でわかること
・2026年2月、30万人超の日本人男性のY染色体を解析した論文がネイチャー・メディシンに載ったこと
・日本人男性の系統は C 10.3%、D 34.0%、O 53.7% に分かれること
・Dは「他の東アジア人集団にはほとんど認められない、日本人集団に特有な系統」とされること
・Dが多いのは世界で日本列島・チベット高原・アンダマン諸島の三か所だけであること
・アイヌで87.5%、沖縄で55.6%、本土で32〜39%、与論島で特に高いこと(西表島は5%)
・漢民族では1.9%、朝鮮半島でも数%に留まること
・アンダマンのオンゲ族は調べた23人全員がDだったこと(外部と混ざった大アンダマン人は0%)
・日本のD1a2a・チベットのD1a1・アンダマンのD1a2bは5万年前後に分かれた別々の枝であること
・2003年にナイジェリアで見つかった3人の男性が、2019年の全ゲノム解読で「D0」と名付けられたこと
・D0とDの分岐は約7万1,400年前で、Dはアフリカ生まれだと分かったこと
・2026年7月、群馬県・居家以岩陰遺跡の8,300年前の縄文女性IY1のゲノムが67倍という高精度で読まれたこと
・縄文人は東アジアの中で早い時期に分岐した系統で、最終氷期に集団を縮めた後、小さいまま安定していたこと
・稲作以前の縄文人にも、でんぷんを消化するAMY1遺伝子のコピー数が比較的多かったこと
・2025年10月の論文で、縄文人はデニソワ人由来のDNAが東ユーラシアで最も少ないと分かったこと
・3万年前の丸木舟で台湾から与那国島まで45時間かけて渡る実験が成功していること
・2024年の理研の解析で、日本人は縄文系・関西系・東北系の3つの祖先の混合で説明できること
・ゲノム全体に占める縄文系は沖縄28.5%、東北18.9%、関西13.4%であること
・Y染色体は父方の一本の線しか追えず、「日本人は特別」という結論にはならないこと
・Dを持つ男性は2型糖尿病に対して保護的な効果があると報告されたこと
■参考文献
①Nature Medicine (2026年2月23日オンライン). 東京大学・大阪大学・理化学研究所・国立がん研究センターほか(研究責任者 岡田随象). 30万人超の日本人男性Y染色体解析. 国立がん研究センター プレスリリース 2026年2月25日.
②Haber, M., et al. (2019). A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans Out of Africa. Genetics, 212(4), 1421–1428.
③Ishiya, K., Mizuno, F., Gojobori, J., et al. (2026). High-coverage ancient genomes reveal divergent population histories and prehistoric starch-related genetic variation in Japan. PNAS. doi:10.1073/pnas.2606162123(金沢大学プレスリリース 2026年7月28日)
④Current Biology 35(20) (2025年10月). An early East Asian lineage with unexpectedly low Denisovan ancestry.
⑤Liu, X., Terao, C., et al. (2024). Decoding triancestral origins, archaic introgression, and adaptive evolution of the Japanese population. Science Advances(理化学研究所プレスリリース 2024年4月18日)
⑥Hammer, M. F., et al. (2006). Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes. Journal of Human Genetics, 51, 47–58.
⑦Tajima, A., et al. (2004). Genetic origins of the Ainu inferred from combined DNA analyses of maternal and paternal lineages. Journal of Human Genetics, 49, 187–193.
⑧Shinka, T., et al. (1999). Genetic variations on the Y chromosome in the Japanese population and implications for modern human Y chromosome lineage. Journal of Human Genetics, 44, 240–245.
⑨Thangaraj, K., et al. (2003). Genetic affinities of the Andaman Islanders, a vanishing human population. Current Biology, 13(2), 86–93.
⑩Yan, S., et al. (2011). An updated tree of Y-chromosome Haplogroup O and revised phylogenetic positions of mutations P164 and PK4. European Journal of Human Genetics, 19, 1013–1015.
⑪Kaifu, Y., et al. (2025). Palaeolithic voyage for invisible islands beyond the horizon. Science Advances, 11(25).
⑫国立科学博物館 (2016–2019). 3万年前の航海 徹底再現プロジェクト.
⑬Wikipedia「ハプログループD (Y染色体)」「ハプログループD1a2a (Y染色体)」(各集団の頻度の一次出典の参照に使用)
■チャプター
0:00 OP
1:39 第1章 父から息子へだけ渡る文字
2:56 第2章 3人に1人
4:37 第3章 地図の空白
6:26 第4章 5万年前の別れ
7:39 第5章 ナイジェリアの3人
9:29 第6章 8,300年前の女性
12:54 第7章 出会わなかった人々
14:58 第8章 三つの祖先
16:45 第9章 反対尋問
18:05 第10章 東の果て
■映像について
挿絵はAIで生成したイメージ画像、図解は上記論文の数値をもとに作成したものです。実際の人物・遺物・場所の写真ではありません。
ナレーション: VOICEVOX:青山龍星 / VOICEVOX:四国めたん
BGM: Ancient memories / 蒲鉾さちこ
#ミステリー #都市伝説 #日本人の起源 #縄文人 #DNA #Y染色体 #ハプログループD #考古学 #遺伝学 #古代史
日本人男性の3人に1人が父から受け継ぐ「Y染色体ハプログループD」。その“いちばん近い親戚”は、アジアではなくナイジェリアで見つかりました。
このチャンネルは、遺伝学・考古学・地質学などの最新の論文を手がかりに、世界に残された謎を視聴者の皆さんと一緒に紐解いていくというコンセプトで運営しています。
確認できる事実にもとづいて構成していますが、そこから先の解釈はあくまで考察であり、確定した答えではありません。特定の民族・国・団体を優劣づけたり批判したりする意図はありません。
ぜひ、みなさんの謎に対する仮説や意見もコメントでお聞かせください。
■この動画でわかること
・2026年2月、30万人超の日本人男性のY染色体を解析した論文がネイチャー・メディシンに載ったこと
・日本人男性の系統は C 10.3%、D 34.0%、O 53.7% に分かれること
・Dは「他の東アジア人集団にはほとんど認められない、日本人集団に特有な系統」とされること
・Dが多いのは世界で日本列島・チベット高原・アンダマン諸島の三か所だけであること
・アイヌで87.5%、沖縄で55.6%、本土で32〜39%、与論島で特に高いこと(西表島は5%)
・漢民族では1.9%、朝鮮半島でも数%に留まること
・アンダマンのオンゲ族は調べた23人全員がDだったこと(外部と混ざった大アンダマン人は0%)
・日本のD1a2a・チベットのD1a1・アンダマンのD1a2bは5万年前後に分かれた別々の枝であること
・2003年にナイジェリアで見つかった3人の男性が、2019年の全ゲノム解読で「D0」と名付けられたこと
・D0とDの分岐は約7万1,400年前で、Dはアフリカ生まれだと分かったこと
・2026年7月、群馬県・居家以岩陰遺跡の8,300年前の縄文女性IY1のゲノムが67倍という高精度で読まれたこと
・縄文人は東アジアの中で早い時期に分岐した系統で、最終氷期に集団を縮めた後、小さいまま安定していたこと
・稲作以前の縄文人にも、でんぷんを消化するAMY1遺伝子のコピー数が比較的多かったこと
・2025年10月の論文で、縄文人はデニソワ人由来のDNAが東ユーラシアで最も少ないと分かったこと
・3万年前の丸木舟で台湾から与那国島まで45時間かけて渡る実験が成功していること
・2024年の理研の解析で、日本人は縄文系・関西系・東北系の3つの祖先の混合で説明できること
・ゲノム全体に占める縄文系は沖縄28.5%、東北18.9%、関西13.4%であること
・Y染色体は父方の一本の線しか追えず、「日本人は特別」という結論にはならないこと
・Dを持つ男性は2型糖尿病に対して保護的な効果があると報告されたこと
■参考文献
①Nature Medicine (2026年2月23日オンライン). 東京大学・大阪大学・理化学研究所・国立がん研究センターほか(研究責任者 岡田随象). 30万人超の日本人男性Y染色体解析. 国立がん研究センター プレスリリース 2026年2月25日.
②Haber, M., et al. (2019). A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans Out of Africa. Genetics, 212(4), 1421–1428.
③Ishiya, K., Mizuno, F., Gojobori, J., et al. (2026). High-coverage ancient genomes reveal divergent population histories and prehistoric starch-related genetic variation in Japan. PNAS. doi:10.1073/pnas.2606162123(金沢大学プレスリリース 2026年7月28日)
④Current Biology 35(20) (2025年10月). An early East Asian lineage with unexpectedly low Denisovan ancestry.
⑤Liu, X., Terao, C., et al. (2024). Decoding triancestral origins, archaic introgression, and adaptive evolution of the Japanese population. Science Advances(理化学研究所プレスリリース 2024年4月18日)
⑥Hammer, M. F., et al. (2006). Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes. Journal of Human Genetics, 51, 47–58.
⑦Tajima, A., et al. (2004). Genetic origins of the Ainu inferred from combined DNA analyses of maternal and paternal lineages. Journal of Human Genetics, 49, 187–193.
⑧Shinka, T., et al. (1999). Genetic variations on the Y chromosome in the Japanese population and implications for modern human Y chromosome lineage. Journal of Human Genetics, 44, 240–245.
⑨Thangaraj, K., et al. (2003). Genetic affinities of the Andaman Islanders, a vanishing human population. Current Biology, 13(2), 86–93.
⑩Yan, S., et al. (2011). An updated tree of Y-chromosome Haplogroup O and revised phylogenetic positions of mutations P164 and PK4. European Journal of Human Genetics, 19, 1013–1015.
⑪Kaifu, Y., et al. (2025). Palaeolithic voyage for invisible islands beyond the horizon. Science Advances, 11(25).
⑫国立科学博物館 (2016–2019). 3万年前の航海 徹底再現プロジェクト.
⑬Wikipedia「ハプログループD (Y染色体)」「ハプログループD1a2a (Y染色体)」(各集団の頻度の一次出典の参照に使用)
■チャプター
0:00 OP
1:39 第1章 父から息子へだけ渡る文字
2:56 第2章 3人に1人
4:37 第3章 地図の空白
6:26 第4章 5万年前の別れ
7:39 第5章 ナイジェリアの3人
9:29 第6章 8,300年前の女性
12:54 第7章 出会わなかった人々
14:58 第8章 三つの祖先
16:45 第9章 反対尋問
18:05 第10章 東の果て
■映像について
挿絵はAIで生成したイメージ画像、図解は上記論文の数値をもとに作成したものです。実際の人物・遺物・場所の写真ではありません。
ナレーション: VOICEVOX:青山龍星 / VOICEVOX:四国めたん
BGM: Ancient memories / 蒲鉾さちこ
#ミステリー #都市伝説 #日本人の起源 #縄文人 #DNA #Y染色体 #ハプログループD #考古学 #遺伝学 #古代史